單元一：小月歸來

杜小月化名為柯雲在戲班子裏唱戲，暗中尋找證據為自己的丈夫何文遠翻案而重現京城，剛開始被蒙在鼓裏的紀曉嵐和乾隆也慢慢的看出了點端倪，而收到夏德赫賄賂的和珅怕甘肅的事情敗露，決定殺人滅口。沒想到乾隆突然出手相救，還把柯雲接到宮中，最後柯雲還被皇太后認做乾女兒。柯雲誤中和珅的奸計，洩露了自己的身份，還被乾隆關進大牢。紀曉嵐一方面使計讓和珅替杜小月向乾隆求情，另一方面進宮和乾隆把何文遠一案和甘肅難民一事聯繫到一起，最後乾隆決定和紀曉嵐微服出巡。和珅知道事情瞞不住，為求自保對夏德赫暗下毒手，接著把何文遠殺死以絕後患。當紀曉嵐、杜小月等人趕到甘肅大牢時，一切為時已晚……杜小月自己有喪事在身，不適合住在宮裏，重新回到了草堂。紀曉嵐剛開始還不亦樂乎，但沒想一個「帥小叔子」闖入了他們的生活……


單元二：拉大旗作虎皮

「帥小叔子」是杜小月死去丈夫的弟弟何文進，本來是托杜小月辦事的，但卻鬼使神差的陷入個了一個離奇的事件。京城出現了一伙人，聲稱只要「意思」到了，甚麼事都能鏟平，紀曉嵐深入虎穴，竟在一座大宅內發現乾隆的親筆匾額，通過調查慢慢的發現整件事情與很多人有著千絲萬縷的關係──和珅、葛貝子、崔公公……正當水落石出之際，乾隆親審的犯人被殺死，杜小月與何文進又離奇失蹤，就連皇上貼身的太監崔公公也上吊自殺，眼看所有重要的線索都要斷了，乾隆鋌而走險，喬裝改扮深入虎穴，但沒想到身份被人識破。皇上失蹤，葛貝子欲改朝換代，心慌的和珅不得已和紀曉嵐聯手營救皇上……


單元三：筆談奇案

乾隆打算廣開言論，但無人敢進諫，紀曉嵐獻計初見成效，這也嚇壞了心懷鬼胎的和珅。皇上問老紀的主意從哪而來，紀曉嵐說因為杜小月近期總去「筆談」，還迷上了一個才華橫溢的齙牙哥，自己的主意也是在茶館中學到的。乾隆大有興致，約和珅、紀曉嵐一起去探個究竟。在茶室，三人偶遇一位梅姓的美貌女子──梅映雪，為了接近她，三人在茶館幹起了雜役──和珅是茶水，老紀賣乾果，皇上滿處給人研墨。和珅慢慢聯繫到梅海泉案，慌忙找出涉及此案的滿官伊爾泰，問清情況，給自己想後路。紀曉嵐在茶室找出海泉案線索，乾隆也了解到海泉案的真相，梅映雪要求乾隆殺掉當今皇上，乾隆無奈只好和梅映雪夜探皇宮，去殺自己，梅映雪冰雪聰慧識出了乾隆的身份。伊爾泰已經被和珅滅口，皇上向梅映雪認錯，並示情示愛，沒想到……


單元四：人在草木中

乾隆為了穩定江山社稷，分散紀曉嵐、和珅的勢力，仿古效今，把二人的職位對調，還把二人居住的府邸也對調，這可把二人忙的不亦樂乎。來京城參加鬥茶大會的芊芊是紀曉嵐的鐵杆粉絲，她誤認為暫住紀府的和珅是紀曉嵐，又在杜小月的誤導下以為自己是格格而夜探皇宮，結果弄得身受重傷。但天真可愛的芊芊博得了紀曉嵐、和珅甚至乾隆的喜愛。為了不刺激受傷的芊芊，三人決定先隱瞞真相。在和府的紀曉嵐認識了和珅的十三夫人——荔枝，單純的荔枝竟以為和珅是大好人。紀曉嵐用心良苦，想方設法勸解荔枝，知道真相的荔枝揭發了和珅的罪狀，並決定離開和府和芊芊的叔叔任草木廝守終生。惱羞成怒的和珅暗中派人在荔枝的茶中下毒，沒想到毒茶卻被芊芊喝掉……


單元五：忠義祠

乾隆欲撥三百萬兩銀子治理漕運，沒想到戶部尚書稱國庫已空，乾隆命人查賬，紀曉嵐也參與其中，結果紀曉嵐發現皇上的開銷最大。除此之外盛京將軍福貴在青化山修建忠義祠的開支100萬兩，讓紀曉嵐覺得蹊蹺。紀曉嵐設法暗示乾隆去青化山的忠義祠看個究竟，和珅一方面百般阻撓，另一方面督促福貴抓緊修建忠義祠。乾隆終於同意去青化山，在路上，和珅為了拖延時間費盡心思，終於趕在乾隆到達前，把忠義祠建好。眾人來到青化山後，發現此忠義祠並非彼忠義祠，乾隆大怒親審福貴，福貴認罪，並供出和珅，乾隆把和珅收押帶回京城。眾人對處置和珅的問題上各抒己見，紀曉嵐卻一言不發。最後皇上下不了決心殺和珅，只是下旨讓和珅去掃茅廁。治理漕運已經迫在眉梢，但銀子還沒有湊齊，皇上只好讓和珅戴罪立功。和珅不擇手段很快就把錢募齊，百姓和官員怨聲載道，而乾隆卻睜一隻眼閉一隻眼……